Si le disque n'est pas trop vieux, il faut faire un test complet SMART pour avoir davantage d'informations. Tu devrais trouver facilement ça sous un live CD Ubuntu... Y a un test court et un test complet, je te conseille de faire d'abord le court qui pourra te fournir des éventuelles infos de panne rapidement, alors que le long (complet) met plusieurs heures.
Si le SMART détecte des secteurs défectueux en trop grand nombre (typiquement les cas où le disque devient peu utilisable), il devrait être possible de récupérer les données sans trop de souci à partir de la partition "moins utilisée". Par contre, je te déconseille de continuer à utiliser le disque, car typiquement, les secteurs "blacklistés" parce que défectueux ne sont pas dépendants de la partition utilisée (autrement dit, le nombre de secteurs de "secours" est partagé entre toutes les partitions, et typiquement un disque devient inutilisable quand le nombre de secteurs de "secours" est atteint).
Avec un peu de chance, ton disque est juste passé en sécurité. Au bout d'un certain nombre d'opérations I/O, tu devrais repasser en mode normal s'il n'y a pas d'erreurs supplémentaires, ce qui est souvent le cas sur les disques qui "viennent de lâcher". Ca devrait te permettre de l'utiliser encore un petit peu à "pleine vitesse", le temps de faire un backup ou d'organiser ta migration. Si ce n'est pas passé en sécurité, tu peux toujours tenter un formatage de bas niveau. Parfois, cela permet de "contourner" certains secteurs défectueux sans devoir piocher dans le paquet de "secours", et donc de continuer à utiliser ton disque.